มหาวิทยาลัยราชภัฏสกลนคร ในฐานะสถาบันอุดมศึกษาของรัฐ ได้จัดให้มี หน่วยตรวจสอบภายใน เป็นหน่วยงานที่ทำหน้าที่ตรวจสอบและประเมินผลการดำเนินงานของมหาวิทยาลัยอย่างเป็นอิสระและเที่ยงธรรม รวมทั้งให้คำปรึกษาและข้อเสนอแนะต่อผู้บริหารและหน่วยรับตรวจ เพื่อสนับสนุนการบรรลุวัตถุประสงค์และพันธกิจของมหาวิทยาลัย
หน่วยตรวจสอบภายใน มหาวิทยาลัยราชภัฏสกลนคร มีพัฒนาการของการดำเนินงานให้สอดคล้องกับบริบทและการเปลี่ยนแปลงของมหาวิทยาลัย โดยในระยะแรก งานตรวจสอบภายในให้ความสำคัญกับการตรวจสอบความถูกต้องของการปฏิบัติงานด้านการเงิน การบัญชี การพัสดุ และการปฏิบัติตามกฎหมาย ระเบียบ และข้อบังคับที่เกี่ยวข้อง ต่อมาได้มีการปรับเปลี่ยนแนวทางการตรวจสอบให้มีลักษณะเป็น การตรวจสอบโดยใช้ความเสี่ยงเป็นฐาน (Risk-Based Internal Audit) มากยิ่งขึ้น โดยพิจารณาความเสี่ยงที่อาจส่งผลกระทบต่อการบรรลุยุทธศาสตร์ เป้าหมาย และพันธกิจของมหาวิทยาลัย ทั้งนี้ หน่วยตรวจสอบภายในมีบทบาทด้านการบริการให้ความเชื่อมั่น (Assurance) และบทบาทด้านการให้คำปรึกษา (Consulting) โดยมุ่งสร้างความเข้าใจแก่หน่วยรับตรวจเกี่ยวกับการบริหารความเสี่ยง ระบบการควบคุมภายใน การปฏิบัติตามกฎหมายและระเบียบที่เกี่ยวข้อง ตลอดจนเสนอแนวทางในการปรับปรุงกระบวนการทำงานให้มีประสิทธิภาพ โปร่งใส ตรวจสอบได้ และสามารถป้องกันหรือลดความเสี่ยงที่อาจเกิดขึ้น
การดำเนินงานของหน่วยตรวจสอบภายในยังเชื่อมโยงกับระบบการกำกับดูแลของมหาวิทยาลัย โดยมีการรายงานผลการตรวจสอบและประเด็นสำคัญต่อคณะกรรมการตรวจสอบเพื่อให้ผู้บริหาร และสภามหาวิทยาลัยได้รับรู้ รับทราบและสามารถนำการรายงานผลการตรวจสอบไปใช้ประกอบการตัดสินใจในการบริหารจัดการหน่วยงานได้ หน่วยงานสามารถกำหนดมาตรการควบคุม การบริหารความเสี่ยง และการปรับปรุงการดำเนินงานของหน่วยงานได้อย่างเหมาะสม และหน่วยตรวจสอบภายใน ได้มีการพัฒนาบุคลากรจากบทบาทการตรวจสอบความถูกต้องและการปฏิบัติตามกฎ ระเบียบ ไปสู่การเป็น กลไกสนับสนุนการกำกับดูแล การบริหารความเสี่ยง และการควบคุมภายในของมหาวิทยาลัย โดยมุ่งสร้างคุณค่าเพิ่มให้แก่หน่วยรับตรวจและมหาวิทยาลัยโดยรวม สอดคล้องกับปรัชญาการดำเนินงานของหน่วยตรวจสอบภายในที่ว่า
“สร้างคุณค่าเพิ่ม เสริมความเชื่อมั่น สอบทานความถูกต้อง”
สำหรับการปฏิบัติตนของผู้ตรวจสอบภายในยึดถือหลักความเป็นอิสระ ความเที่ยงธรรม ความซื่อสัตย์สุจริต การรักษาความลับ และความเป็นมืออาชีพ ตลอดจนพัฒนาคุณภาพงานตรวจสอบอย่างต่อเนื่อง เพื่อให้การตรวจสอบภายในสามารถตอบสนองต่อความเสี่ยงและการเปลี่ยนแปลงของมหาวิทยาลัย และเป็นกลไกสำคัญในการส่งเสริมให้มหาวิทยาลัยราชภัฏสกลนครบรรลุเป้าหมายตามพันธกิจอย่างมีประสิทธิภาพ ประสิทธิผล โปร่งใส และตรวจสอบได้